Главная цель Северо-Западного теруправления Росрыболовства — обеспечивать рациональное использование и воспроизводство ресурсно-сырьевой базы внутренних водоемов Северо-Западного региона, совершенствовать систему охраны, государственного контроля и надзора за водными биоресурсами и средой их обитания с применением инновационных технологий и новых современных методик расчетов оценки влияния на ВБР для компенсации наносимых ущербов при современном антропогенном и техногенном воздействии на природу.
В мае, сентябре 2011 года под контролем Северо-Западного территориального управления Федерального агентства по рыболовству за счет компенсации ущерба водным биологическим ресурсам и среде их обитания планируется выпустить в бассейн Балтийского моря около 200 млн. штук подрощенной личинки и 155 тыс. сеголеток сига.